黑客帝国三结尾矩阵清除史密斯后，为什么会出现先知？
史密斯在被尼奥终结后由于悖论（因为在尼奥终结史密斯前是史密斯杀了尼奥，而尼奥的“复活”又是程序设定以外的，所以本应该按程序已死的人反而杀死了杀他的人，这样系统就陷入一个死循环，既编的系统程序无法计算出史密斯被死人终结的结果，于是拒绝删除史密斯）成了一个病毒程序，他感染了先知程序，把先知程序变成了自己病毒程序的一个拷贝——就好像我们现在电脑里的正常文件被病毒感染后转成了病毒的帮凶一样。
尼奥被史密斯复制后获得了史密斯的原始代码，这样系统就可以通过把他们两个一起删除（就是计算为他们两个一起死亡）来结束系统死循环。也就是我们现在的杀毒＋修复Bug，把被感染的程序恢复到原样。于是被感染的先知程序就恢复原样了。
黑客帝国系列中既然尼奥是矩阵编写的程序那为什么不告诉特工史密斯尼奥是“可信任程序”，不要删除，
矩阵编写程序的唯一原则就是“平衡”，所以才有尼奥和特工的势均力敌。而且即使尼奥被删除，矩阵仍有后手继续“平衡”，但矩阵没有把“爱情”算在平衡的公式里，或者无法把“爱情”算在工式里，导致尼奥因为爱情重新复活了。这时矩阵的平衡工作出现危机，复活后尼奥杀死了特工，特工得到了尼奥的代码，特工的目的是毁灭一切，这时候矩阵的平衡工作不仅失效自身也受到了威胁。对于尼奥一方，特工的目的成了尼奥与矩阵谈判的唯一砝码，所以尼奥被矩阵重新改造，帮助矩阵用同归于尽的方式杀死特工，矩阵则不在毁灭锡安。也就是说矩阵并不是万能的，也有他控制不了的情况，而且有过好像是4次控制不了，只不过那时候控制不了，他就重新编写程序，自身不受威胁，和这一次不太一样。
黑客帝国中的矩阵到底指什么？
关于3楼同志的解释
这里有几点不同意见
1 matrix翻译过来是母体/电子矩阵 在影片中体现出来的是整个系统程序 在matrix全3部中没出现超出系统程序之外的世界 从虚拟人类世界到虚拟人类世界的人类所看到的机器世界 从视觉上纯机器世界到电影里地下城Zion 包括Neo所看到工程师都是系统的一部分 这样才能解释为什么尼欧在机器世界里仍然可以空手废章鱼
2 史密斯在1中是类似管理员功能的一种维序程序 如3楼所说不是杀毒程序
在被NEO粉碎后（即被matrix中另一个基本程序破坏）没有完全从系统清除 成为冗余代码 变性成为病毒
3 见问题1 都是在矩阵中 工程师形象只是系统制造者（造物主）在matrix中以自己形象设计的类似镜像程序 用以给出答案 该答案也就是让NEO这个程序完成系统自动更新升级的启动程序
4 见3
总的来说影片就是表达了一个叫matrix的虚拟世界
在这个一切都是程序表达的世界中 设计者把程序设计成机器统治者人类 部分反抗的人类躲在地下一个叫zion的城市里找寻救世主伺机夺回曾经的地位
而两方发生的一切都是造物主已经设计好的程序的运行
matrix就像个超级游戏 在A（机器） B（人类）两方的无休止的运行中得到系统的升级
黑客帝国有几部，分别什么剧情
第一部
在矩阵中生活的一名年轻的网络黑客尼奥发现，看似正常的现实世界实际上似乎被某种力量控制着，尼奥便在网络上调查此事。而在现实中生活的人类反抗组织的船长莫菲斯也一直在矩阵中寻找传说的救世主，就这样在人类反抗组织成员崔妮蒂的指引下，两人见面了，尼奥也在莫菲斯的指引下，回到了真正的现实中，逃离了矩阵,这才了解到，原来他一直活在虚拟世界当中，真正的历史是，在20XX年，人类发明了AI(人工智能)，然后机械人叛变，与人类爆发战争，人类节节败退，迫不得已的情况下，把整个天空布满了乌云，以切断机械人的能源(太阳能)，谁知机械人又开发出了新的能源---生物能源，就是利用基因工程，人工制造人类，然后把他们接上矩阵，让他们在虚拟世界中生存，以获得多余的能量，尼奥就是其中一个。尼奥知道后，也加入了人类反抗组织，在莫菲斯训练下，渐渐成为了一名厉害的“黑客”，并渐渐展露出，与其他黑客的不同之处，让莫菲斯也更加肯定他就是救世主，就在这个时候，人类反抗组织出现了叛徒，莫菲斯被捕，尼奥救出了莫菲斯，但在逃跑过程中，被矩阵的“杀毒软件”特工杀死，结果反而让尼奥得到了新的力量，并复活了，真正的成为了救世主，并把在矩阵无所不能的特工杀死了（删除了） 从此，人类与机械的战争，进入了一个新的时代。
第二部
上回说到尼奥终于意识到自己的能力和使命，在中弹“复活”的同时，他也变成了无所不能“救世主”。结尾的“飞升”象征着人类超级英雄的诞生：尼奥将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战，并将以胜利者的姿态结束这场战斗，还人类以自由之身。他的使命会实现吗？母体会那么甘心被摧毁吗？ 实际上，整个是尼奥探寻自己使命背后真相的过程，他要为自己的行动寻找一个可以接受的理由。在上集打败密探史密斯、救出墨菲斯之后，尼奥随同亲密爱人崔尼蒂和其他战友一起，乘坐Nebuchadnezzar号飞船返回地球上最后一个人类据点——锡安基地。在那里，他们和其他自由战士们聚集到了一起，其中包括墨菲斯的甜蜜冤家——奈奥比美眉。另外，基地的政治家们也上场了。 就在这时，母体系统决定“先下手为强”，派遣了为数250000的电子乌贼大军，开始进攻锡安基地，微弱的基地防守力量根本不足以对抗如此强大的机甲兵团，看来人类最后的香火也岌岌可危；当然，墨菲斯他们的飞船上有各种各样的资料，自然少不了中国那几本名为《左传》《史记》之类古籍的电子版本，尼奥他们一下便想到了“围魏救赵”的良招，决定再次潜入母体，从内部破坏它，最后达到消灭机甲兵团的目的。同时，尼奥也想再和“先知”谈一谈，以便更多地了解自己的神圣使命。 可是，“母体取经”的道路注定是凶险多端的：在寻找母体系统内唯一知道系统弱点的“制钥者”的过程中，NEO、墨菲斯和翠尼蒂遇到了前所未有的困难：敌人的能力升级了，数量更是增多了，尼奥的超能力受到致命的挑战，墨菲斯和翠尼蒂对NEO的信心也受到无情事实的打击。究竟尼奥他们能不能完成任务后从母体内部全身而退？锡安基地的命运如何？
第三部
面对如潮的电子乌贼，人类城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲与入侵者决一死战。此时，“救世主”尼奥的身体和思想却意外分离，后者再度陷入到“母体”中。墨菲斯和崔妮蒂也不得不回到“母体”和守护天使一起寻找他。 锡安的局势越来越危险，机器的攻击却丝毫没有因为人类的反抗而减弱。此时，被叛徒射瞎双眼的尼奥，依然想通过希望去实现预言。这时，特工史密斯控制了先知，并变得越来越强大，威胁到了整个"母体"的稳定。在返回锡安的途中，飞船遭到电子乌贼的突袭，崔妮蒂死了，重伤的尼奥来到机器城市。 在和机器的谈判中，机器答应为了人类和机器的共同利益，尼奥去消灭史密斯，而机器不再摧毁锡安。人类迎来新的和平。
关于黑客帝国系列电影的一些疑问
矩阵就是那个虚拟世界，矩阵是一个巨大的网络，连接着无数人的意识，系统分配给他们不同的角色，就象电脑游戏中的角色扮演游戏一样，只是他们没有选择角色的权利和意识。人类通过这种联网的虚拟生活来维持自身的生存需要，但Matrix中的智能程序，也就是先知的角色，发现在系统中有1%的人由于自主意识过强，不能兼容系统分配的角色，如果对他们不进行控制就会导致系统的不稳定，进而导致系统崩溃。因此编写Matrix的智能程序，也就是建筑师就制造了“救世主”，让他有部分自主意识，并成为觉醒人类的领袖，带领他们建造了锡安。 母体不控制是虚拟世界，它是整个机器帝国的总称，是人类取的名字。 而那个机器乌贼帝国是由机器大帝控制。而母体、矩阵都是由那个机器大帝控制。 你如果看过黑客帝国3就知道，在矩阵里，有一个永远不变的定律——平衡。实际上尼奥和史密斯是维持矩阵平衡的两个极端产物，史密斯是尼奥的负影、另一面。电影中的特工史密斯实际上就是矩阵这个程序世界中的杀毒程序，他们在矩阵中是没有身体的，由于他们是杀毒程序，所以他们被矩阵赋予了超越常人的能力。在矩阵中他们具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体。 尼奥最后可以战胜特工，实际上是因为他复活后具有了识别矩阵代码的能力，并可以轻松改写这些代码，所以特工就不能再利用超能力战胜他了。 特工史密斯被尼奥消灭后，因为在他被尼奥消灭前明明是他先杀死了尼奥，所以这就导致了一个逻辑错误。因为这种程序上的逻辑运算错误，导致了特工史密斯不但拒绝被系统删除，而且由杀毒程序变成了病毒，最后危害到了整个矩阵世界。 因为这个逻辑错误是由尼奥导致的，所以特工史密斯就变成了和尼奥相对的负极。最后尼奥选择了让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡。 其实你看了黑客帝国3就知道，尼奥不是打不过史密斯，他是和机器大帝做了笔交易，让矩阵恢复原装，尼奥牺牲自己，史密斯被消灭，停止战争，换取人类和机器间的和平。因为史密斯若再复制下去，就会使整个系统崩溃，造成整个机器帝国毁灭。但机器会毁灭人类。于是，他就进入矩阵和史密斯打，并故意让史密斯感染，这样两者被同时删除。
黑客帝国中的"矩阵"是什么?为什么在尼欧前有6任救世主?如何杀死史密斯?
尼奥选择让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡。 关于Matrix Matrix是一个建立在数学基础上的严整系统，一切都是有规律的，包括特工们和尼奥的超能力在内，都是包含在这个系统中的。而尼奥这个“救世主”的产生，则和数学中的哥德尔命题有关。奥地利数学家哥德尔在1931年发表了题为《论数学原理及有关系统的形式不可判定命题》的论文，其中提出这样一个观点，在任何数学系统中，只要其能包含整数的算术，这个系统的相容性就不可能通过几个基础学派所采用的逻辑原理建立。简单地说，就是在任何系统中，总有些真理是游离于逻辑之外的，这些真理就叫做歌德尔命题。 在Matrix中，尼奥就是在Matrix这个严整系统中不能被数学推得的歌德尔命题，不符合系统的规律。（建筑师对尼奥的谈话中涉及部分）当尼奥重生后，他就担负起系统所有的扰动，所有的规则在他面前都变得透明，因此他能够看到系统中别人所看不到的东西。先知叫尼奥回到源头去终止灾难，在数学逻辑中就是将歌德尔命题变成整个系统的一部分，当作系统的一个变量，从而消除整个系统的不确定性。如果尼奥当初选择了毁灭锡安的门，他所携带的代码将反馈给系统，将系统的稳定性提高到一个新阶段。而这个选择的前提则是系统中没有斯密斯这个狂人。但从数学的角度上来说，这样的稳定也是暂时的，不是对系统的彻底修正，新的系统还是会产生自己的歌德尔命题，从而继续这个轮回。这就是为什么在尼奥之前会有六任救世主的原因。 按照建筑师最初编写救世主时的任务，救世主的使命就是在锡安运行一段时间后，将锡安的代码带回到Matrix的源程序进行重装，同时机器摧毁锡安，完成Matrix系统的升级。之后救世主将按照初始设置，带领16女7男返回真实世界，再开始重建锡安，等待下一代的救世主。而尼奥与前任们不同的是，建筑师在他的意识中编写了关于爱的编码，这本来是系统处于不断升级的需要，也是考察人类反应的新实验。但这个关于爱的编码，不但导致了尼奥在第二集中做出违背程序设置的选择，而且在第三集中将“爱情”升华为“博爱”，从而最后终结了战争，终止了矩阵和锡安之间的循环。 特工史密斯 电影中的特工史密斯实际上就是矩阵这个程序世界中的杀毒程序，他们在矩阵中是没有身体的，由于他们是杀毒程序，所以他们被矩阵赋予了超越常人的能力。在矩阵中他们具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体。 （史密斯和尼奥、莫非斯打斗场景） 尼奥最后可以战胜特工，实际上是因为他复活后具有了识别矩阵代码的能力，并可以轻松改写这些代码，所以特工就不能再利用超能力战胜他了。 （尼奥复活后场景） 特工史密斯被尼奥消灭后，因为在他被尼奥消灭前明明是他先杀死了尼奥，所以这就导致了一个逻辑错误。因为这种程序上的逻辑运算错误，导致了特工史密斯不但拒绝被系统删除，而且由杀毒程序变成了病毒，最后危害到了整个矩阵世界。 因为这个逻辑错误是由尼奥导致的，所以特工史密斯就变成了和尼奥相对的负极。最后尼奥选择了让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡。参考资料： http://www.cctv.com/program/dsfys/05/01/index.shtml