入侵网站后台可以干什么？得到WEBSHELL可以干什么？上传大小马可以得到服务器么？
楼上的楼上不正确，不要误导别人。
网站的后台是用来管理网站内容的，是一个很低级的权限。挂马、DDOS至少需要web权限，就是你说的webshell。得到webshell，需要提权到服务器权限。是属于高级权限，服务器会有很多个网站（独立服务器除外),这时候你控制了一个服务器（服务器你可以理解就是一台电脑)。也就控制了整个服务器上的所有网站。
大、小马是一种特殊的脚本程序，用于提权。
如果仅是技术研究，用于提升安全知识，以后为国家的信息安全做贡献，你可以PM与我讨论。如果是为了那些黑色利益，就不必了，同时建议你不要去接触违法的事情，国家现在对这块管得很严，前几个月对国内各大黑客性质论坛进行了洗牌。
莫伸手，伸手去国外，常在河边走，终有湿鞋日。
怎样入侵一个网站，需要哪些工具和流程
这个常用的话就是利用脚本漏洞，工具的话一般有JSKY以及明小子等的，流程当然是找后台以及暴管理员用户和密码，如果是SA权限的话，直接入侵提权就可以
入侵网站的命令大全?
黑客常用命令大全
net user heibai lovechina /add 加一个heibai的用户密码为lovechina
net localgroup Administrators heibai /add 把他加入Administrator组
net start telnet 开对方的TELNET服务
net use z:\127.0.0.1c$ 映射对方的C盘
net user guest /active:yes 将Guest用户激活
net user guest lovechina 把guest的密码改为lovechina
net user 查看所有用户列表
net user 用户名 /delete 删掉
net time \\127.0.0.1 得到对方的时间， get c:\index.htm d:\ 上传的文件是INDEX.HTM，它位于C:\下，传到对方D:\ copy index.htm \\127.0.0.1\c$\index.htm 本地C盘下的index.htm复制到127.0.0.1的C盘
NET VIEW 显示域列表、计算机列表或指定计算机的共
计算机运行命令全集 winver---------检查Windows版本
wmimgmt.msc----打开windows管理体系结构
wupdmgr--------windows更新程序
winver---------检查Windows版本
wmimgmt.msc----打开windows管理体系结构
wupdmgr--------windows更新程序
wscript--------windows脚本宿主设置
write----------写字板winmsd-----系统信息
wiaacmgr-------扫描仪和照相机向导
winchat--------XP自带局域网聊天
mem.exe--------显示内存使用情况
Msconfig.exe---系统配置实用程序
mplayer2-------简易widnows media player
mspaint--------画图板
mstsc----------远程桌面连接
net use \\ip\ipc$ " " /user:" " 建立IPC空链接
net use \\ip\ipc$ "密码" /user:"用户名" 建立IPC非空链接
net use h: \\ip\c$ "密码" /user:"用户名" 直接登陆后映射对方C：到本地为H:
net use h: \\ip\c$ 登陆后映射对方C：到本地为H:
net use \\ip\ipc$ /del 删除IPC链接
net use h: /del 删除映射对方到本地的为H:的映射
net user 用户名 密码 /add 建立用户
net user guest /active:yes 激活guest用户
net user 查看有哪些用户
net user 帐户名 查看帐户的属性
net localgroup administrators 用户名 /add 把“用户”添加到管理员中使其具有管理员权限,注意：administrator后加s用复数
net start 查看开启了哪些服务
net start 服务名 开启服务；(如:net start telnet， net start schedule)
net stop 服务名 停止某服务
net time \\目标ip 查看对方时间
net time \\目标ip /set 设置本地计算机时间与“目标IP”主机的时间同步,加上参数/yes可取消确认信息
net view 查看本地局域网内开启了哪些共享
net view \\ip 查看对方局域网内开启了哪些共享
net config 显示系统网络设置
net logoff 断开连接的共享
net pause 服务名 暂停某服务
net send ip "文本信息" 向对方发信息
net ver 局域网内正在使用的网络连接类型和信息
net share 查看本地开启的共享
net share ipc$ 开启ipc$共享
net share ipc$ /del 删除ipc$共享
net share c$ /del 删除C：共享
net user guest 12345 用guest用户登陆后用将密码改为12345
net password 密码 更改系统登陆密码
netstat -a 查看开启了哪些端口,常用netstat -an
netstat -n 查看端口的网络连接情况，常用netstat -an
netstat -v 查看正在进行的工作
netstat -p 协议名 例：netstat -p tcq/ip 查看某协议使用情况（查看tcp/ip协议使用情况）
学会入侵网站需要会哪些知识
想学网站入侵，首先需要学习基本知识，各种名词，要不然在学习的时候，连讲的基本用语都听不懂，数据库是必须要学习的，开发语言也需要学习。
既然是菜鸟，建议从基础学起，从百度里找个好的论坛。网站入侵主要是找网站的漏洞，漏洞主要来自编程人员的粗心，但是想要找到这些漏洞，你也必须要掌握一定的知识才能掌握的。
以下一些知识是必须掌握的：
HTML
PHP
ASP
ASP.net
SQL
JavaScript
C/C++
Ruby
Python
LUA
前六个是做网站用的，后面都是编程语言，c/cpp是基础就不说了，ruby可以用来编写通用网关接口脚本，还可以被嵌入到HTML里，Python也可以做网站，很多攻击，探测脚本就是Python写的。
入侵网站需要什么步骤
嗯....不知道你要干什么，希望你不要干坏事。
第一步：情报收集与分析
用扫面器或者人工的对服务器的状态进行探知，获得以下信息： 服务器类型（大致分为windows服务器和linux服务器）、服务器版本、服务器的网络布局（自己与网站服务器的相对网络位置，是否有防火墙，不过现在的服务器一般都在防火墙后面）、服务器上开启的端口号、服务器上运行的服务及其版本、网站的网页脚本类型、脚本版本等等。最后根据以上信息判断该服务器可能存在的漏洞，这将是下一步的基础。
第二步：攻击开始
根据上一步收集到的漏洞信息开始对网站服务器发动攻击。一般是登陆服务器上开启的服务并猜测该服务的密码（弱口令攻击，现在基本失效）如果猜对便可以根据服务获得相应的服务器操作权限，如果运气好，这里就可以直接拿下服务器。或者根据服务器上运行的服务所存在的溢出漏洞进行溢出攻击（不过，溢出漏洞并不好找）。或者跟据网页脚本上的漏洞进行网页渗透。
第二步的主要目的就是为了获得一个可以在目标服务器上执行一定命令的权限，这也是最难的一步。
第三步：权限提升
如果只是为了从服务器上拿些东西，或者修改服务器上的一些文件，利用第二步获得权限可能已经足够，但是如果遇到细心的管理员进行了严格的权限管理，或者想完全控制服务器还需要提权操作。也就是利用第二步获得的权限获得跟高的服务器使用权限的操纵。其实现方法根据不同的入侵路径，会很多。这里只提一下大概思路，windows服务器：获得服务器系统盘的读写权（有时可以跳过）、获得system权限、建立自己的隐藏管理员用户、留下后门或木马。linux：获得root权限、留下后门。
最后就是清理自己的脚步，删除或者修改服务器上的日志文件，不然管理员会很容易察觉到被入侵。
网站入侵的形式其实很多，上面只是较为常用的形式而已。其他的还有 中间人攻击 社会工程学攻击等等。
以上只是个人的见解，希望能帮到你......
什么是脚本?脚本入侵又是怎么回事？
脚本script是使用一种特定的描述性语言，依据一定的格式编写的可执行文件，又称作宏或批处理文件。脚本通常可以由应用程序临时调用并执行。各类脚本目前被广泛地应用于网页设计中，因为脚本不仅可以减小网页的规模和提高网页浏览速度，而且可以丰富网页的表现，如动画、声音等。举个最常见的例子，当我们点击网页上的E－mail地址时能自动调用Outlook Express或Foxmail这类邮件软件，就是通过脚本功能来实现的。也正因为脚本的这些特点，往往被一些别有用心的人所利用。例如在脚本中加入一些破坏计算机系统的命令，这样当用户浏览网页时，一旦调用这类脚本，便会使用户的系统受到攻击。所以用户应根据对所访问网页的信任程度选择安全等级，特别是对于那些本身内容就非法的网页，更不要轻易允许使用脚本。通过“安全设置”对话框，选择“脚本”选项下的各种设置就可以轻松实现对脚本的禁用和启用。
网站被入侵了脚本是别人恶意插入脚本还是服务器运营商搞得鬼，麻烦高手分析下
理论上 运营商不至于搞鬼 特别是这么明显的鬼
至于你发现的顶部问题
首先确认一下弹窗位置
不仅看网页 JS 还要看数据库 都查查异常
如果落实了 你机器上没这个东西
那就很有可能是arp欺骗类攻击
比如其他机器中毒然后内网攻击 导致很多机器出现访问网页添加了代码
当然 这只是基本检测和排查方法
如果时间长搞不定影响公司网站形象 或者需要商业检测修复
也可以联系我们
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网站被入侵了传了webshell怎么办
如何防止网站被上传WebShell网页木马?
1 )网站服务器方面，开启系统自带的防火墙，增强管理员账户密码强度等，更改远程桌面端口，定期更新服务器补丁和杀毒软件。
2）定期的更新服务器系统漏洞（windows 2008 2012、linux centos系统），网站系统升级，尽量不适用第三方的API插件代码。
3）如果自己对程序代码不是太了解的话，建议找网站安全公司去修复网站的漏洞，以及代码的安全检测与木马后门清除，国内推荐SINE安全公司、绿盟安全公司、启明星辰等的网站安全公司，做深入的网站安全服务,来保障网站的安全稳定运行，防止网站被挂马之类的安全问题。
4）尽量不要把网站的后台用户的密码设置的太简单化,要符合10到18位的大小写字母+数字+符号组合。
5）网站后台管理的路径一定不能用默认的admin或guanli或manage 或文件名为admin.asp的路径去访问。
6）服务器的基础安全设置必须要详细的做好,端口的安全策略，注册表安全，底层系统的安全加固，否则服务器不安全,网站再安全也没用